צמחי מרפא משתייכים למשפחות בוטניות שונות והם יכולים להיות עצים, שיחים, פרחים או פירות וירקות. נהוג ומקובל לחלק את צמחי המרפא לצמחים מערביים וצמחים מזרחיים (סיניים והודיים), אך ישנם גם צמחים שמגיעים משימוש מסורתי באזורים שונים. צמחים אחרים נפוצים לשימוש בעיקר בקרב הבדווים וערבי הארץ למטרות ריפוי.